Катерина, я бы делила девочек и мальчиков по разным классам только первые 4 года, потом бы я делила их по склонностям к наукам и направлениям, а не по полу.
Что касается физры и трудов. Мне не нужен токарный станок, так же как он не нужен очень многим мальчикам. Так же лично мне не давались все эти девочковые шьём-вяжем и пр. Единственное, что я делаю хорошо - вышиваю, мой муж умеет не хуже, а вот пуговицы пришиваются уже хуже. В трудах спасает только то, что это, фактически, никого не интересующий урок и все это понимают.
С физрой сложнее. Есть девочки-спортсменки и мальчики-ботаники. Первые перебивают средние нормы для мальчишек, вторые иногда не тянут нормы девочек. Но всё же, физиология у нас разная, не стоит отрицать.